Неприменимость для большого количества компаний
Использовать метод чистых активов очень удобно при оценке финансовых организаций, где активы, во-первых, проще оценить, чем в других компаниях и, во-вторых, именно активы в них в основном формируют выручку (посудите сами: кредиты в банках, как правило, формируют львиную долю их прибылей). Вообще, любые капиталоемкие предприятия имеет смысл оценивать по рыночной стоимости их активов (вдобавок, например, к DCF модели).
Уникальность активов компании - это не самая большая проблема данного метода оценки: при наличии времени и ресурсов можно вполне успешно оценить компанию через рыночную стоимость ее имущества.
Самая большое ограничение этого метода оценки состоит в том, что он не применим для большого количества компаний из-за того, что реальная стоимость их бизнеса не то, чтобы сильно отличается от стоимости их активов, а что активы компании вообще слабо описывают её деятельность.